Il est rare de voir la mésange huppée se régaler de petites graines aux mangeoires car cet oiseau est un habitué des bois d'épicéas et principalement de pins. Son régime est constitué d'insectes, de larves et d'araignées mais aussi de graines de conifères en hiver. Ayant pris une graine à la mangeoire, elle la cassera ensuite entre ses pattes avec son bec puissant.