La Côte-aux-Fées est située à proximité du canton de Vaud et de la France, à l'endroit le plus à l'ouest du canton de Neuchâtel. On y parvient en voiture depuis Buttes mais aussi de Sainte-Croix (canton de Vaud). On y trouve un service de car. A proximité du village même, se trouvent plusieurs hameaux et des fermes isolées.